Вероятная передача церкви бывших монастырских зданий, расположенных на территории музея-заповедника «Херсонес Таврический», может привести его в список монументов, расположившихся под угрозой, считают в Союзе музеев Российской Федерации. «Всякие изменения в существующем заповеднике немедленно приведут его в список монументов, расположившихся под угрозой, а далее — к исключению его из списка монументов мирового значения (Список ЮНЕСКО)», — говорится в оповещении, размещенном на сайте союза. «Церковная составляющая является в этом случае только частью историко-культурного образа».
В Союзе музеев подчеркнули, что передача музея-заповедника Русской православной церкви (РПЦ) может навредить ее репутации «в сложной крымской ситуации».
На сайте синодального отдела по взаимоотношениям Церкви с обществом и СМИ Московского патриархата появилось обращение председателя данного отдела Владимира Легойды, в котором он называет беспочвенными разговоры о потенциальной передаче ряда объектов прежнего Херсонесского Князь-Владимирского мужского монастыря Крымской епархии. В министерстве культуры, в ведении которого находится заповедник, назвали вопрос о смене владельца «Херсонеса» дискуссионным. В свою очередь руководитель «Херсонеса» Светлана Мельникова считает, что передача в использование церкви объектов заповедника нанесет ему большой вред.
Удовлетворение поступившего заявления Симферопольской и Крымской Епархии будет означать, что музей-заповедник лишится здания античной истории, византийской экспозиции, реставрационных мастерских, практически всех административных и фондовых помещений.
Основной первопричиной несвоевременности передачи объектов музея-заповедника Крымской епархии уполномоченный Московского патриархата считает отсутствие у музея помещений для хранения коллекций. В РПЦ напомнили, что на территории музея находятся строения, до этого принадлежавшие Херсонесскому Князь-Владимирскому мужскому монастырю. Летом 2013 г Херсонес вошел в списки Всемирного наследства ЮНЕСКО в категории «Древний город Херсонес Таврический и его ансамбля».