Модель Meizu Pro 6S получила 12-Мп тыльный сенсор IMX386 от Сони вместо 21-Мп матрицы IMX230, которая была использована в Meizu Pro 6.
Внешне Meizu Pro 6s не достаточно чем отличается от Pro 6. Он оснащён 5.2-дюймовым Super AMOLED-дисплеем с разрешением 1920 на 1080 пикселей и функцией 3D Press, обеспечивающей ему чувствительность к силе нажатия. Pro 6s имеет 5,2-дюймовый экран, десятиядерный процессор MediaTek Helio X25, 4 Гбайт оперативной памяти, носитель на 64 Гбайт, экран с поддержкой распознавания силы нажатия 3D Press. Памяти тут — 4 и 64 ГБ оперативной и встроенной. Возможность расширения памяти не предусмотрена. Питание телефона обеспечивает аккумулятор емкостью 3060 миллиампер-часов, при всем этом присутствует функция быстрой подзарядки mCharge 3.0. Фирменная кольцевая вспышка осталась на собственном месте. Pro 6S оборудовали новым датчиком Сони IMX386 с разрешением 12 мегапикселей и размером пикселея 1,25 мкм (у Pro 6 применяется 21-мегапиксельный Сони IMX230). Она, как и прежде, представлена 5-мегапиксельным датчиком. С 2560 мАч в Pro 6, он стал 3060 мАч. Pro 6s также поддерживает быструю зарядку (24W).
Как и подобает телефону 2016 года, Pro 6S укомплектован сканером отпечатков пальцев, портом USB-С 3.1, 2-мя SIM-картами и андроид 6.0 Marshmallow под оболочкой Flyme. Есть и чип Cirrus Logic CS43L36. Смартфон работает под управлением Flyme 5 OS, а стоить он будет $399. Его место занял Pro 6s — он превосходит Pro 6 по всем параметрам, при этом удивляет и то, что официальный ценник на Pro 6s ниже, чем на Pro 6. Meizu оценивает флагман в 2 699 юаней либо 399 долларов.